गैस के कुओं को अक्सर एक्वीफर्स के माध्यम से या उसके पास ड्रिल किया जाता है, और प्रदूषित कुएं के पानी के बारे में शिकायतें असामान्य नहीं हैं। अक्सर एक डर व्यक्त किया जाता है, विशेष रूप से उन क्षेत्रों में जहां फ्रैकिंग नया है, यह है कि रॉक अंडरग्राउंड का फ्रैक्चरिंग दूषित तरल पदार्थों और मुक्त शेल गैस को शेल डिपॉजिट से और पानी की मेज से ऊपर की ओर पलायन करने की अनुमति देगा। उद्योग के अधिकारी जोर देते हैं, और अधिकांश पर्यावरण अधिकारी सहमत हैं, कि यह बेहद संभावना नहीं है। एक विशिष्ट फ्रैक नौकरी 1,500 से 2,500 मीटर (5, 000 से 8, 000 फीट) की गहराई पर की जाती है। शेल डिपॉजिट और एक एक्वीफर के फर्श के बीच (जो आमतौर पर सतह से कुछ सौ मीटर से अधिक नहीं पाया जाता है) चट्टान की कई परतें हैं जो गैस और तरल की घुसपैठ को रोकती हैं-हालांकि कुछ वैज्ञानिकों का मानना है कि कुछ भूगर्भीय संरचनाओं में एक मौका है, जो कि शेल गैस मौजूदा दोषों का पालन करने में सक्षम हो सकता है और जल तालिका के लिए ऊपर की ओर फ्रैक्चर कर सकता है। कुछ वैज्ञानिकों द्वारा सुझाए गए एक अधिक संभावित परिदृश्य पुराने, अप्रयुक्त कुओं के माध्यम से शेल गैस का प्रसार हो सकता है जो पर्याप्त रूप से कैस या प्लग नहीं किए गए हैं। स्थानीय प्रदूषण का एक अक्सर प्रलेखित कारण एक सक्रिय गैस कुएं के हिस्से में दोषपूर्ण आवरण है जो एक एक्वीफर से होकर गुजरता है, जिससे उत्पादन गैस और तरल पदार्थ पानी की आपूर्ति में पारित होने की अनुमति देते हैं।
2010 में, एक अमेरिकी डॉक्यूमेंट्री फिल्म क्रिटिकल ऑफ फ्रैकिंग ने गैसलैंड में, कोलोराडो के फोर्ट ल्यूपटन में एक रसोई के नल की आग की लपटों के अपने फुटेज के साथ एक सनसनी बनाई। फिल्म की सफलता (जिसे अकादमी पुरस्कार के लिए नामांकित किया गया था) ने इंटरनेट पर कई नकल वीडियो को प्रेरित किया। इस तरह की घटनाएं वास्तव में ड्रिलिंग के लिए ट्रेस करने योग्य हो सकती हैं, जो कई अवसरों पर एक्वीफर्स के करीब स्थित गैस की पहले से अज्ञात जेबों को परेशान करती है, जिससे मीथेन गैस को सामान्य से अधिक सांद्रता में अच्छी तरह से पानी की अनुमति देने में सक्षम बनाया गया है। हालांकि, इस तरह की गड़बड़ी लगभग किसी भी तरह की ड्रिलिंग द्वारा बनाई जा सकती है, चाहे वह गैस, तेल, या यहां तक कि अच्छी तरह से पानी के लिए हो। इस कारण से, उद्योग के अधिकारियों, यह मानते हुए कि ड्रिलिंग प्रक्रियाओं को सख्त मानकों के लिए आयोजित किया जाना चाहिए, फिर भी जोर देकर कहते हैं कि विस्फोटक स्थितियां लगभग निश्चित रूप से सीधे हाइड्रोलिक फ्रैक्चरिंग के कारण नहीं होंगी, जो गहरे भूमिगत हैं।
